在冷水机组循环冷却水的处理中，由于空调冷却水系统短期内没有结垢、腐蚀和藻类滋生，短期内不会对系统产生破坏性影响，因此运行管理人员不会足够的重视。另外空调冷却水系统相对简单，设计人员对其重视不够，而冷却水的处理是与给排水和暖通空调有关的一项重要工作，冷却水系统大多由暖通空调人员进行设计。在设计过程中，针对空调冷水机组冷却水系统易结垢、腐蚀、细菌、藻类滋生等问题，其处理方法也不同于冷水系统。冷水机组冷却水的处理方法有以下三种：

1、化学法。目前大型水冷却器的冷却水系统多采用化学方法，在冷却水中加入阻垢剂、缓蚀剂、杀菌剂及其配套清洗剂，以形成一整套冷却水处理技术。可供大型空调冷却水处理设计参考，阻垢可以保证传热效果(节能)，缓蚀剂和杀菌灭藻剂可以减少设备腐蚀，延长设备寿命。

2、加药处理方法：该方法较早应用于热水锅炉和船舶系泊处理。近年来，该方法也已用于冷却水系统。常用的化学品是固体结晶硅酸盐薄膜腐蚀抑制剂。 实践证明，不同的涂层剂需要不同的溶解温度。为了在循环水系统中填充配料系统，水温通常可以达到溶解温度，并且灌溉适用于水合作用。在系统上，应特别注意防止水温过低。如果水温太低，膜腐蚀抑制剂的溶解不好，就会影响腐蚀抑制效果。

3、物理方法：近年来了广泛应用。它是一种操作成本低、使用方便、控制简单、无污染的理想水处理方法。事实上，早在20世纪60年代，外国就把注意力从化学方法转向了物理发展。目前常用的物理方法有磁法、电解法、超声波法、静电法等。